為貫徹創新驅動發展戰略，解決科技與經濟“兩張皮”這一根本問題，農業部著力創新科技管理體制機制，利用現代農業產業科技創新中心、農業科技創新聯盟等載體，圍繞產業鏈構建創新鏈，打造區域農業發展增長極、培育農業發展新動能。
在聯盟建設方面，以解決行業、產業和區域性重大問題為導向，整合優勢科技資源，搭建多學科協同、科企緊密協作、科技創新上中下游銜接的平臺。按照“建起來、干起來、強起來”三步走戰略，目前已經建設了50多個聯盟，并推動聯盟圍繞創新任務干起來。今年以來，正在按照“內生機制要落地、核心成果要落地、實體化運行要落地”的要求把聯盟“強起來”，重點打造了20個標桿聯盟，這些聯盟以保障綠色農產品有效供給和產業結構調整為主攻方向，凝練了117項年度創新任務，整合了5.7億元各類資金，吸納了343家科研機構、推廣單位、企業和1923名科研骨干參加，推動了華北平原小麥玉米節水節肥等40項聯盟科技成果轉化落地。重點形成了實體化運行、一體化協同、共建共享三大機制。
在科創中心建設方面，以科技創新為基礎、產業化為方向，著力推動要素集聚、關鍵技術集成、關聯企業集中、資源配置集約、優勢產業集群，會同地方政府創建一批科技創新能力強、科技型企業強、輻射帶動能力強的國家現代農業產業科技創新中心。目前，已批復建設的江蘇南京、山西太谷、四川成都三地國家現代農業產業科技創新中心各具特色、開局良好。太谷科創中心已投入1.8億元專項資金，圍繞雜糧雜豆、設施蔬菜、干鮮果業等地方特色優勢產業，規劃建設了“一城三園五區”的總體布局。江蘇南京、四川成都兩個中心也聚焦優勢領域或產業，加大投入、創新機制，推進科企合作，即將形成優勢產業集群，帶動地方農業快速發展。
